◇はじめに

◇書籍案内

• 三中信宏『統計思考の世界：曼荼羅で読み解くデータ解析の基礎』2018年6月1日第1刷刊行｜2023年2月18日第2刷刊行，技術評論社，東京，239 pp., 本体価格2,300円, ISBN:978-4-7741-9753-1 → 版元ページ｜コンパニオンサイト

• 三中信宏『みなか先生といっしょに 統計学の王国を歩いてみよう：情報の海と推論の山を越える翼をアナタに！』2015年6月5日第1刷刊行｜2017年3月15日第2刷刊行｜2025年1月20日第3刷刊行，羊土社，東京，191 pp., 本体価格2,300円, ISBN:978-4-7581-2058-6 → 目次｜版元ページ｜コンパニオンサイト

◇統計高座サイト

• 形態測定学（応用編）の講義用ページ（2007年10月〜2010年3月，通年：東京農業大学）
• 形態測定学（基礎編）の講義用ページ（2006年2月〜2007年10月，通年：東京農業大学）
• 生物統計学の講義用ページ（2005年4月〜2006年2月，通年：東京農業大学）

　※本講義はオンラインで開講します

• パラメーターと推定値：記述統計学と推測統計学のちがい
• 確率変数と確率分布　参考：確率分布曼荼羅（ウェブ版）

• 正規分布 \( N(\mu,\sigma^2) \) の諸性質（線形変換での正規性保存・関連確率分布の導出・中心極限定理）
• R パッケージ「TeachingDemos」を用いた演習

• 実験計画法の “ふるさと” 探訪
• 実験計画法の“家訓”（反復実施・無作為化・局所管理）
• 実験処理区のレイアウトと線形統計モデルの構築
• 完全無作為化法のもとでのデータ解析の手順

• 完全無作為化法のもとでのデータ解析の手順［続］
• 偏差・平方和・平均平方（分散）・ \( F \) 値
• 正規分布が降臨する
• 実験計画法での仮説検定の考え方について
• R を用いた分散分析の実習

• 分散分析から多重比較へ
• 水準間の平均値差の検定で生じる第一種過誤の制御
• R を用いたいくつかの多重比較検定法

• 乱塊法のもとでの線形統計モデルとデータ処理の手順
• 複数の要因を含む実験計画と要因間の交互作用について
• 二要因乱塊法とその応用

• 線形統計モデルを再考する
• モデル選択論：尤度とAIC
• Rを用いたモデル選択の実習：多項式回帰を中心に

• 一般化線形統計モデル（GLM）
• Rを用いたGLMの実習：ロジスティック回帰とポアソン回帰

• 二つの変量間の共分散と相関係数
• Rを用いた2変量正規分布の実習
• 多変量データと高次元空間

• Rを用いた多変量解析の実習（1）：クラスター分析
• Rを用いた多変量解析の実習（2）：主成分分析

• ベイズの定理とベイジアン確証推論について
• ベイジアンMCMCによる事後確率分布推定の演習※参考：MCMC Robot
• 課題レポートの出題と説明

---

1. 講義時間は毎週木曜第4限（14:55〜16:40）．本講義はすべてオンライン講義なので Zoom と Discord のアプリを持参PCに事前にインストールしてください．Zoom を用いたオンライン講義については東京大学情報基盤センター＆大学総合教育研究センター〈情報システムの総合案内サイト @ 東京大学〉をごらんください．
2. 講義に関する情報（Zoom会議室URLを含め）は UTOL の該当ページに掲載しました（随時更新）．講義資料類（スライド，スクリプト，データファイルなど）もすべてこのページから配布します．
3. 自宅や研究室など外部から受講される場合は容量無制限の Wi-Fi ルーターを各自用意してください．
4. 【R事前インストールのお願い】今回の講義で使用するRならびにパッケージ R Commander，さらに RStudio については事前にインストールした上で，各自の責任で作動確認をお願いいたします．まずはじめに使用するPC環境を整えてください．とくに，Mac OS X については，事前に X11 を下記の XQuartz プロジェクトのサイトからインストールしておいてください（→ Apple「XQuartz」）．X11 がないと R Commander が使用できなくなりますのでこれは必須です．
5. Windows 版 Rのインストールの手順と起動の確認については「R-InstallationGuide.zip」をご覧ください．Mac OS X 版あるいは Linux 版の R / R Commander / RStudio を使用される場合は，同様のやり方で R 関連ファイルを事前にインストールした上で，各自の責任で作動確認をお願いいたします．
6. 初回講義では R 関連ソフトウェアのインストールのトラブル個別対応の時間も設けていますので，フシアワセに打ちひしがれる受講生はご利用ください．
7. 本講義に関する質問回答と情報提供には Discord を利用する予定です．

◇連載〈統計の落とし穴と蜘蛛の糸〉

羊土社の雑誌『実験医学』に2014年2月号から2015年4月号まで掲載されたワタクシの連載記事〈統計の落とし穴と蜘蛛の糸〉記事のオンライン版です．以前は〈実験医学online〉上で公開されていたコンテンツがまるごと同社の新設サイト〈Smart Lab Life〉にて再公開されましたのでごらんください．［2018年2月3日］

• 第1回　データ解析の第一歩は計算ではない（2014年2月号, pp. 442-447：2017年11月10日公開）
• 第2回　データの位置とばらつきを可視化しよう（2014年4月号, pp. 935-940：2017年11月17日公開）
• 第3回　データのふるまいをモデル化する（2014年6月号, pp. 1427-1433：2017年11月24日公開）
• 第4回　パラメトリック統計学への登り道〔1〕：ばらつきを数値化する（2014年8月号, pp. 2160-2163：2017年12月1日公開）
• 第5回　パラメトリック統計学への登り道〔2〕：自由度とは何か（2014年9月号, pp. 2314-2318：2017年12月8日公開）
• 第6回　確率変数と確率分布をもって山門をくぐる（2014年10月号, pp. 2642-2645：2017年12月15日公開）
• 第7回　正規分布という王様が誕生する（2014年11月号, pp. 2990-2994：2017年12月22日公開）
• 第8回　ピアソンが築いたパラメトリック統計学の土台（2014年12月号掲載, pp. 3123-3126：2018年1月5日公開）
• 第9回　秘宝：確率分布曼荼羅の発見！（2015年1月号掲載, pp. 110-113：2018年1月12日公開）
• 第10回　実験計画はお早めに：完全無作為化法（2015年2月号掲載, pp. 510-513：2018年1月19日公開）
• 第11回　正規分布を踏まえたパラメトリック統計学の降臨（2015年3月号掲載, pp. 628-632：2018年1月26日公開）
• 第12回　統計データ解析の地上世界と天空世界：連載の総括として（2015年4月号掲載, pp. 978-982：2018年2月2日公開）

※本連載はすでに単行本として出版されています：三中信宏『みなか先生といっしょに 統計学の王国を歩いてみよう：情報の海と推論の山を越える翼をアナタに！』（2015年6月5日刊行，羊土社，東京，191 pp., 本体価格2,300円, ISBN:978-4-7581-2058-6 → 目次｜版元ページ｜コンパニオンサイト）．

◇農環研ウェブ高座 〈農業環境のための統計学〉

本連載記事は，独立行政法人農業環境技術研究所が発行するウェブマガジン『農業と環境』に2012年8月から2013年8月まで連載されました．

• 第1回　前口上：統計学の世界を鳥瞰するために［No. 148 | 2012年8月1日発行］
• 第2回　統計学のロジックとフィーリング［No. 149 | 2012年9月1日発行］
• 第3回　直感的な素朴統計学からはじまる道［No. 150 | 2012年10月1日発行］
• 第4回　統計学的推論としてのアブダクション［No. 151 | 2012年11月1日発行］
• 第5回　データを観る・見る・診る［No. 153 | 2013年1月1日発行］
• 第6回　情報可視化と統計グラフィクス［No. 154 | 2013年2月1日発行］
• 第7回　データのふるまいを数値化する：平均と分散［No. 155 | 2013年3月1日発行］
• 第8回　記述統計学と推測統計学：世界観のちがい［No. 156 | 2013年4月1日発行］
• 第9回　統計モデルとは何か：既知から未知へ［No. 157 | 2013年5月7日発行］
• 第10回　確率変数と確率分布：確率分布曼荼羅をたどる［No. 158 | 2013年6月1日発行］
• 第11回　正規分布帝国とその臣下たち［No. 159 | 2013年7月1日発行］
• 第12回　パラメトリック統計学の世界を眺める［No. 160 | 2013年8月1日発行］

※本連載は技術評論社から刊行される下記書籍の一部として含まれます：三中信宏『統計思考の世界：曼荼羅で読み解くデータ解析の基礎』（2018年6月6日刊行，技術評論社，東京，ca 240 pp., 本体価格2,300円, ISBN:978-4-7741-9753-1 → 版元ページ｜コンパニオンサイト）

◇統計高座中継（YouTube）

以下に公開する統計高座の YouTube 動画ファイルは，2011年2月8日（火）〜10日（木）の三日間にわたって，九州大学大学院比較社会文化研究科（伊都キャンパス）で私が行なった集中講義〈データ解析概論〉の全録画です（→九大・比社文サイト）．集中講義のシラバスにしたがって動画ファイルは下記の通り分割され YouTube 上に公開されています．［謝辞］集中講義当日の撮影と動画編集をしていただいた楠見淳子（九大・比文）さんに深く感謝いたします．（23 April 2011）

• 2月8日（火） ——
1. 統計学概論−統計学的な「ものの見方」 → 1｜2｜3
2. Ｒ／Ｒcmdrのインストールとパッケージ動作確認
1. インストール　Win編 → 1
2. インストール　Mac編 → 1
3. データ解析は視覚化に始まり視覚化に終わる → 1｜2｜3
4. 確率変数・確率分布とパラメトリック統計理論 → 1｜2｜3
• 2月9日（水） ——
1. はじめに「ばらつき」ありき−偏差・平方和・分散 → 1｜2
2. 実験計画法と分散分析；多重比較；線形モデル
1. Rでのデータ読み込み → 1
2. 完全無作為化法 → 1｜2｜3
3. 多重比較 → 1｜2
4. 乱塊法 → 1｜2｜3｜4
5. 乱塊法応用編 → 1｜2｜3
• 2月10日（木） ——
1. モデル選択論；一般化線形モデルへの拡張
1. モデル選択論 → 1｜2｜3｜4｜5｜6
2. 線形モデルを鍛える → 1｜2
3. 一般線形モデル → 1｜2｜3
2. 共分散と相関係数；多変量パラメトリック分布 → 1｜2｜3
3. リサンプリング計算統計学と多変量解析 → 1｜2｜3
4. ベイズ統計学とベイジアンMCMC／質疑応答 → 1｜2｜3

◇〈R〉への参道

1. Rインストレーションガイド［2016年9月12日バージョン］ → R-InstallationGuide.zip（自己解凍ファイル）※R / RStudio / R Commander のインストールガイド．Windows PC を念頭に書かれているが，他のOSでも参考になるだろう．
2. Ｒ最新版のインストール方法 → Cf: RjpWiki「Rのインストール」
3. Windows環境で「R」を導入するための絶対確実な方法（2014年11月12日）
4. CRANに詣でる
5. Ｒを知る［参考になるサイトや資料］→ Cf: RjpWiki「リンク集」
6. Ｒを学ぶ［教科書・参考書リスト］→ Cf: RjpWiki「参考書リスト」

1. 正規分布のグラフィクス → RPubs
2. 正規分布の棄却域を図示 → RPubs
3. カイ二乗分布のグラフィクス → RPubs
4. ｔ分布のグラフィクス → RPubs
5. Ｆ分布のグラフィクス → RPubs
6. 二次元正規分布

1. 実験計画と分散分析——総論
2. 【Box1】１要因完全無作為化法→データファイル：Box1_R.tab，Box1_R.data
3. 【Box2】１要因乱塊法→データファイル：Box2_R.tab，Box2_R.data
4. 【Box3】２要因乱塊法→データファイル：Box3_R.tab，Box3_R.data
5. 【Box4】２要因分割区法（Split-plot）→データファイル：Box4_R.tab，Box4_R.data
6. 【Box5】２要因細分区法（Strip-plot）→データファイル：Box5_R.tab，Box5_R.data
7. ネスト分散分析

1. クラスター分析の光と闇
2. 距離指数の原理
3. クラスタリング・アルゴリズム
4. 〈hclust〉→データ
5. 〈agnes〉→データ
6. 〈PAUP*〉による系統解析→データ，最節約分岐図，厳密合意樹

◇大統計大曼荼羅