生物系統学

「歴史」を復元するための方法論を解説

この『生物系統学』では、急速に変貌し、裾野を広げつつある現在の系統学という学問分野をできるだけ幅広い視点から歴史的にとらえ、その現在の姿と将来への展望を見渡しました。とくに、「系統推定」を中心テーマに据えて、なぜ系統を推定し、進化の歴史を復元する必要があるのかという目的を明らかにし、その系統推定のためにはどのような手順を踏めばいいのかについて論じます。とりわけ、分岐学（cladistics）に基づく系統推定および祖先復元の手順、ならびに分子データに基づく分岐学的方法（最節約法）とその応用を論じます。本書には数式はほとんどありません。数式の代わりに、１７０あまりの図が説明をしてくれます。したがって、内容的にはこの分野に関心をもつ学部学生にも十分に読めるレベルであると私は考えます。

一般歴史学としての系統学の位置づけをした第１章、系統樹の情報構造を論じた第２章、1960-70年代の論争を含む系統学の近現代史を論じた第３章、最節約法の観点から分岐学の方法論を体系化した第４章、そして比較生態学・生物地理学・系統分類学・形態学など周辺領域への波及と応用を論じた第５章のそれぞれには、本書で初めて書かれた事項や情報が含まれています。したがって、この『生物系統学』は、現役の研究者にとってもきっと参考になります。

歴史復元に関する方法論は、生物学だけでなく、歴史言語学や写本系図学において古くから用いられてきました。本書で説明する方法は、言語や写本など非生物の系統推定問題にも適用できると考えます。したがって、本書の読者層には、生物学を含む自然科学だけではなく、形而上学、歴史科学、科学哲学、認知科学に関心をもつ人文系の読者も含まれます。

プロローグ：進化生物学に生い茂る系統樹 i

第１章：なぜ系統を復元しなければならないか？ 1

第２章：系統とは何か？ 38

インテルメッツオ：「アルボス」あるいは樹の詩 64

第３章：分岐学：その起源と発展 81

第４章：分岐学に基づく系統推定：最節約原理をどのように用いるか？ 197

第５章：系統が語ることば：分子から形態へ、遺伝子から生物地理へ 330

エピローグ：分岐学の現代的チューンナップ、そしてクリオへの賛辞 401