体系学講義資料
※以下は,筑波大学(2003年1〜2月)ならびに東京大学(2003年5〜6月)における生物系統学の集中講義で配布した資料をhtml化したものである.
○
講義シラバス
○
実際に講義された内容
○参考文献とソフトウェア
・
簡略紹介版
・
教科書および参考書リスト(分類リンク版)
・
教科書および参考書リスト(列挙版)
○分子進化の確率過程
・
確率過程概論(分子進化モデル)
・
最尤法とベイズ法の関係
・
尤度とAIC
(ModelTestを用いたデモ)
○
テストデータ
(PAUP*/MacClade)
○系統推定における統計学的手法
・
導入
・
Bootstrap / Jackknife / PTP / T-PTP / ILD
・
樹長分布
・
崩壊指数
○統計言語
R
について
・
総論
・
R
を用いたブーツストラップの説明
→久保拓也さんによるページ:「
R
を用いたブーツストラップ法の講義資料
」
講義アンケート集計結果